Здраствуйте, Алла!
Хочу успокоить Вас, что никакими последствиями уход с клироса не чреват. Ведь уходя с клироса, Вы не уходите из Церкви Христовой. Вы можете свободно посещать храм Божий, и для этого вовсе не нужно петь на клиросе. Самое главное, чтобы Вы продолжали учавствовать в церковной жизни (исповедовались, причащались и т.д.).
Что же касается отношений с матушкой, то тут советчиком Вам быть не могу. Об этом Вам лучше поговорить с Вашим духовником.
С уважением, свящ. Дионисий Свечников.